رفض زعيم تنظيم القاعدة أيمن الظواهرى الاعتراف بشرعية تنظيم ما يسمى بالدولة الاسلامية وزعيمها أبي بكر البغدادى غير أنه قال انه لو كان في العراق أو سوريا لتعاون معهما ضد التحالف الذى يقوده الغرب.
وفي تسجيل صوتي على الانترنت نقلته وكالة رويتر للانباء قال الظواهرى » لا نعترف بهذه الخلافة ولا نراها خلافة على منهاج النبوة بل هي امارة استيلاء بلا شورى ولا يلزم المسلمين مبايعتها ولا نرى أبا بكر البغدادى أهلا للخلافة « .
وأضاف » لو كنت في العراق أو في الشام لتعاونت معهم في قتال الصليبيين والعلمانيين والنصيريين والصفويين رغم عدم اعترافي بشرعية دولتهم ناهيك عن خلافتهم لان الامر أكبر مني ومن زعمهم اقامة الخلافة » وفق قوله.